复旦大学文物与博物馆学系是国内最早设立文博专业的高校之一。1984年，受国家文物局委托，创设文博专业，9月起招收文博方向研究生；1985年，设立文博本科专业；1989年，复旦大学与国家文物局联合成立文博学院，建文物与博物馆学系、文物保护技术科学系；1996年，文物与博物馆学系建制独立。

文物与博物馆学系致力于为国家的文化事业和文化产业培养具有文博考古专业知识和技能的研究人才、技术人才和管理人才，重点培养考古发现与研究，文化遗产研究、保护和管理，博物馆展示教育与传播，文博文化产业开发等领域的复合型人才。经过三十年建设发展，文物与博物馆学系形成了完整的本科、硕士、博士各层次学历培养体系，拥有1个本科专业（博物馆学），2个硕士点和2个博士点（考古学与博物馆学、文化遗产），1个博士后流动站（考古学）；研究生教育包含博物馆学、考古学、文化遗产、文物保护4个专业方向，是教育部和国务院学位办“全国文物与博物馆专业学位研究生教育指导委员会”秘书长单位。

文物与博物馆学系还入选上海社会科学创新基地（“博物馆建设与管理创新科研基地”）、上海高校优秀人文社会科学研究基地（“中国博物馆建设与管理”）。此外，作为国家文物局高级人才培训基地，承办“全国省级文物局局长班”“全国省级博物馆馆长班”“全国一级博物馆馆长班”“全国文物进出境审核机构负责人培训班”“博物馆管理国际研修班”等重要班次，是全国文博系统高级管理和研究人才培训的主要机构。